交通替代燃料的发展，需要同时满足经济、环保、便捷、可靠和安全等五个基本条件。从经济性角度看，天然气和燃料甲醇明显占优，生物燃料乙醇和电动汽车则相对较差；从环保角度看，电动汽车最为理想，而随着车辆尾气排放标准的不断提高，汽柴油与各类替代燃料的差距正不断缩小；从资源可靠性看，电能和燃料甲醇的供应潜力最大，生物燃料乙醇则受“与人争粮、与粮争地”的影响有所制约；从便捷性看，目前的技术水平下，电动汽车的推广使用仍然十分不便；从安全角度分析，CNG（压缩天然气）汽车和燃料甲醇的推广可能会受到一定阻力。

未来相当长的一段时间内石油仍将是主要交通燃料，同时天然气、燃料甲醇、燃料乙醇、电能等替代燃料也将发挥十分重要和有益的补充作用。其中，以天然气和电能的潜力最大，燃料甲醇、燃料乙醇也有一定的发展空间，但均需要解决一些政策和制度方面的问题。应明确天然气、电能、燃料乙醇和燃料甲醇的优先次序，以市场化为基本原则推动各产业的健康可持续发展。

其一，不搞封闭市场，让消费者自主选择。替代燃料的健康发展需要政策支持，但关键在于好的商业模式，应立足于现实，不依赖政府补贴、不搞强制推广，在统一开放、平等竞争的环境下，让市场发挥资源配置的决定性作用，真正形成企业自主经营、公平竞争，消费者自由选择、自主消费，商品和要素自由流动、平等交换的现代市场体系，提高资源配置效率和公平性。应取消燃料乙醇封闭运行和异质同价的不合理政策，允许市场同时销售不同类型的汽油，将选择权交还给消费者。对于确需政府扶持的替代燃料产业，应细分市场、突出重点，可以在公共服务属性较强的公共交通、专用车辆和物流车队等领域示范推广。

其二，完善燃料价格体系及车辆税费政策。目前，替代燃料相对成品油价格优势的很大一部分，在于不被征收消费税，有的反而还享受着燃油税补贴政策。根据《成品油价税费改革方案》，燃油税改革的重要目的之一是“规范政府收费行为，取消公路养路费等收费，依法筹集交通基础设施养护、建设资金”，消费税收入“主要用于替代公路养路费等六项收费的支出，补助各地取消已审批的政府还贷二级公路收费，并对种粮农民、部分困难群体和公益性行业给予必要扶持”。在替代燃料发展初期，出于产业扶持的需要，减免消费税是十分必要和有益的；但随着其规模的不断扩大，对总税额的影响也相应提高，应考虑择机适度征收消费税的问题。另外，参考欧洲国家经验，汽、柴油消费税的水平和结构也有一定的优化调整空间。能源价格改革的结果，应该使不同燃料的比价趋于合理，体现出优质优价的特点。

其三，加强监管力度，维护市场竞争秩序。市场自由注重的是效率，市场秩序强调的则是公平。交通替代燃料对于多数人而言尚属于新生事物，很小的负面事件也有可能对其长远发展造成致命打击，要吸取LPG（液化石油气）行业的教训，注意避免出现质量、计量、安全、环保以及供应紧张等问题，特别是甲醇汽油掺混比例、改性加剂等扰乱市场秩序的问题。因此，对于交通替代燃料，应首先从国家层面制定系统完善的标准规范和规章制度；其次要明确落实责任，加强生产过程中的环境监管和流通环节的质量、计量、安全监管；另外还要统筹规划发展，有序组织生产调度，确保资源可靠供应。

其四，重点补贴技术研发而非生产销售环节。无论是早期的燃料乙醇，还是近年快速发展的太阳能光伏发电和风电行业，背后都是政府对可再生能源的巨额补贴。但随着其规模的快速扩大，终将超过财政承受的能力，甚至连欧洲都已经开始反省自身的可再生能源政策。而过分依赖补贴发展的替代燃料生产和销售企业，其核心技术研发创新的动力也往往会逐渐弱化，从而违背了政策的初衷，不仅经济性差，而且容易造成效率低下。例如，新能源汽车补贴去年结束后，在新的补贴政策没有出台前，中间的空档期就造成了部分企业新能源汽车的停产。因此，对于替代燃料及交通工具的补贴应重点集中在技术研发领域，从而打造企业真正的核心竞争力，并推动其开发更加成熟的商业模式。

其五，合理规划布局，完善基础网络设施。网络不成熟是限制各种交通替代燃料发展的共性问题，特别是在城市建成区，昂贵稀缺的土地资源和繁琐复杂的审批流程给替代燃料服务网络建设造成了较大阻碍，很多情况下橇装/流动设施的使用也面临合法手续问题。应将加气站/加注站/充电站作为重要的公共基础设施，统筹规划、合理布局，并给予适当政策优惠；简化、加快审批流程，完善标准、制度，鼓励在合适的条件下使用橇装和流动服务设施。